Creo que es porque: (atención, llega otra de mis explicaciones imposibles d entender por lo mal que me explico):
Si descargas todo el archivo de una vez (Sin pararlo y otro dia volviendo a reanudar) Tendrá partes que fallen pero serán pocas, algún que otro MB. En cambio si descargas el archivo en varias veces esas partes erroneas serán muchas más y el programa tiene ke volver a descargarselas.
Por ejemplo si tienes 10MBs erróneos el Azureus tiene k volver a bajarse esos 10MBs, si tienes 2GB erróneos... lo mismo.
Fin de mi típica explicación mal lograda.