Jaja me habias pillado en la hora de la siesta ;P.
Veamos, vayamos por partes, si dices q no tienes virus, ni spyware, tiene tu Windows actualizado al día, estás libre de spyware, y tu disco duro está perfecto...
Quizás sea la versión de el eMule, puede sonar raro, pero creeme he leido / visto cosas de esa magnitud.
Pruedes probar a bajarte otra versión (siempre lo más actualizada posible), de www.emulespana.net en esa página tiene una gran variedad de mods, puedes probar a decantarte por el que más te guste.
Aunque, para quedarme más tranquilo, ¿Cómo se te cuelga? Me explico, windows se te infla a errores, o directamente se bloquea y te toca forzar un reset?
Vamos hablando. S2!