A ver... he formateado y reinstalado ubuntu 6.10, y bueno, al hacer el glxgears me dice lo siguiente:
gatchanz@gatchanz-desktop:$ glxgears
Xlib: extension "GLX" missing on display ":0.0".
Error: couldn't get an RGB, Double-buffered visual
gatchanz@gatchanz-desktop:$
He actualizado el driver desde synaptic y teoricamente que yo sepa esta todo bien... ¿que puede pasar? :/
Si usas KDE:
sudo kate /etc/X11/xorg.conf
Si usas Gnome:
sudo gedit /etc/X11/xorg.con
Ahí busca la sección de la tarjeta gráfica y donde pone driver si tienes aTi pon "fglrx" y si tienes nVidia "nvidia".
Desde synaptic actualizas tus drivers a los de los fabricantes y acuerdate de tener bajado el restricted-modules de tu núcleo linux.
Con eso te tiene que ir por pelotillas. 
Saludos