Buenas.
Hasta ahora, para sacarle el audio a un archivo de video MP4 siempre había usado un archivo .avs de AviSynth usando el filtro DirectShowSource para cargar el video, y dentro del VDubMod, Streams -> Save WAV y me guardaba en un .wav el audio del video.
Pero he formateado y he puesto W7, y ahora cuando hago eso me saca el archivo .wav, sí, pero se oye agudo total, como si estuviese la velocidad de la pista x100.
Alguien sabe a qué puede ser debido? 
Me respondo a mí mismo con la solución al problema, por si le pasa alguna vez a alguien más, y porque además está directamente relacionado con un aspecto que no indiqué en el primer post.
Es problema del Windows 7, ni más ni menos. Lo comentaban en un foro que encontré googleando y es verdad. Algo pasa con Windows 7 y el VirtualDubMod respecto a la hora de extraer un audio sin comprimir (PCM). Tenía otro disco duro, le instalé el XP, hice lo mismo y voilá, el audio se extrae perfectamente y se oye sin problema alguno.
Gracias igualmente 