Para clear cmds simplemente quita la pila que está alojada en la placa base con el ordenador DESENCHUFADO durante 5-10 segs más o menos. Luego la vuelves a colocar en su sitio.Algunos ordenadores nuevos traen una especie de minibateria por lo que debes seguir la guia que te dejo al final.
Después de esto es probable que tu PC pierda la hora, por ejemplo, eso es debido a que vuelve a los valores de fábrica. Es recomendable que entres despues a tus bios para configurarlas (para entrar a bios pulsa supr o F2 o la tecla que te marque) y selecciona una opcion como por ejemplo "Load recomended values" u "Optimized" (si tienes el manual de tu placa, seguro que puedes consultarlo en internet, debes tener un apartado entero dedicado a las bios)
-->Aqui tienes una buena guia http://www.madboxpc.com/contenido.php?id=4195 pero recuerda que cada placa es diferente.
******EDIT: podria algun moderdor borrar las dos respuestas de abajo o que me diga alguien como borrarlo, porque como la pagina no me cargaba al darle a recargar me ha puesto este mensaje y los dos de abajo en blanco. LO SIENTO, Ha sido sin querer