#7 Es por la forma en la que le has contestado, y perdonda, pero el que no lo sabes eres tu.
Hablas de los conectores del panel frontal, que sirven para los leds de encendido y del disco, para el speaker, y para que funcionen el boton de apagar/encender por hardware ademas del reset. Precisamente le pasa lo contrario, la unica forma que tiene de apargalo es de ahi.
Prueba con un live usb, un linux con el linux live usb creator mismo y sin instalarlo como es obvio, prueba el linux y apaga. Si se apaga sin problemas es problema software, sino hardware.
Si es hardware, envialo a pccomponentes como has dicho