Vamos por partes (como decía Jack el destripador):
Yo tenía una partición para windows en ntfs y otra para linux (con una root, una home y la swap). Necesitaba formatear la de windows y, como linux casi no lo uso y necesitaba guardar varios gigas, por no pasarlo a cd todo, he cogido el partition magic y he formateado la partición de linux en fat32, para meter ahí lo que necesitaba.
Entonces reinicio el pc, meto el cd del win2k, inicio la instalación, formateo la particion de ntfs en ntfs otra vez, se instala el windows (weno, una parte, todavía habia ke configurar unas cosas, es decir, no se habia akabado la instalacion completa) reinicia el pc (hasta aquí todo normal), y, entonces, me vuelve a empezar la instalacion de win :S. Lo vuelvo a instalar, ahora quito el cd al reiniciar, y entonces se me inicia LILO, pero se queda solo en la letra L, y empieza a sacar por la pantalla todo el rato el mismo numero (noventa y algo).
Después de un par de intentos más de instalar el win, decido instalar linux otra vez, para ver si se habia jodio alguna cosa. Al final consigo instalarlo, pro esta vez sustituyo el lilo por grub. Bien, se me inicia bien el linux y eso, y la particion fat32 esta intacta.
Ahora, intento instalar el win2k otra vez. Se inicia la instalacion, y llega el momento de seleccionar la particion. Habia 5 opciones: las 3 de linux (root, home, swap), la fat32, y un espacio sin formato (el que ocupaba antes ntfs, pero que para instalar linux he borrad). El orden era: root/home/swap/sinformato/fat. Le doy al sin formato, pero me dice que ahi no puede instalar el win (no daba opcion para formatear, decia algo de que tenia que escribir al principio del disco, pero que no podia). Entonces, al ver que no podia hacer nada, le doy a eliminar las particiones de linux, primero a la root, y vale, la elimina, luego a la home y tb funciona. Pero llega a la swap y se queda colgao (bastante rato).
Entonces reinicio y reintento instalar el win, meto el cd, se carga lo necesario, y luego se pone una pantalla negra con el cursor parpadeando. Esto es normal, siempre se queda así unos 5/10 segundos. El problema es que no pasa de ahí. Se queda colgao.
Decido probar a instalar linux. Vale, se inicia todo y eso. LLega el momento de elegir las particiones y...
TATATACHÁN!
Me dice que la tabla de particiones esta demasiado corrupta. En el esquema del estado de las particiones, me ha parecido que el espacio donde antes estaba la fat (que basicamente es lo que me interesa salvar), ha "desaparecido", mientras que donde estaban el resto de particiones habia un solo recuadro blanco, que se corresponde con el de que no hay ningun formato.
Alguna solucion?
Si alguien tiene idea de cmo poder salvarlo, le estare muy agradecido 
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PD: SI la solucion es hacer algo raro con dos ordenadores, o sea, meter este disco duro en uno que tenga ya el win instalado, y copiar cosas, es viable.
PPD: Decid cualquier cosa que remotamente puede ayudar a algo.
