Es totalmente normal que el CS te vaya peor con una FX que con una MX GF4, tu no andas muy sobrado de Mhz de CPU. y TODOS los drivers que funcionan con las GF FX utilizando una GF FX utilizan MUCHISSIMA MÁS CPU que no utilizando una GF4 MX piensa que las GF4 MX no tenian soporte ni para vertex shaders ni pixel Shaders, solo podian utilizar hasta DX7, hay muchas cosas de las que la CPU de tu PC no tenia de que preocupase con esa gráfica mientras que ocn la GF FX si q deve preocuparse...
Creo que es ligeramente mejor la GF FX 5200 que la GF4 MX sobretodo en juegos nuevos, pero seguramente te vayan mucho peor todos los juegos basados en el HL y su motor (Dod, CS, etc....)
Sencillamente pq utiliznado esta gráfica en lugar de la antigua pongas los detonator o forceware (drivers nvidia) que quieras es como si jugaras con una CPU mucho menos potente.
Bueno al caso intenta con los Omega (www.omegacorner.com) creo que van ligeramente mejor para el CS en CPUs algo justas... pero vamos la solución a tu problema pasa por ir a la tienda y coger una CPU a más Mhz. xD