#1 Se pueden terminar antes o después, pero si has seguido sólo la línea de misiones de clase deberías terminar en torno a nivel 49 o 50. A la que te refieres, Sith Warrior, termina con lo que comentas (que es un spoiler y, quizá, deberías marcar como tal). Después puedes continuar con la línea de misiones de Illum, que se considera como misiones de clase a efectos del bonus X12, y/o Makeb, el planeta de la expansión Rise of the Hutt Cartel.
Para activar las misiones de Makeb tienes que iniciar una misión en el terminal de misiones de tu nave. Para iniciar la cadena de Illum tienes que hablar con un droid en la flota.