Supongo que será simplemente la nomenclatura de la carrera, quizá una sea una licenciatura, otra sea una Ingeniería técnica especializada en Química, y la otra una Ingeniería superior de Técnicas Químicas.
Leyendo en la página de la UPV:
I.T. Industrial, esp. Química Industrial (ETSID)
I. Químico (ETSII)
Licenciatura Química (UV, campus de Burjassot)
Efectivamente son carreras distintas, una es una ingeniería técnica (3 años) otra una ingeniería superior (5 años) y la otra una licenciatura (5 años)
Al menos aquí en Valencia, todo sería cuestión de ver como sería donde tú quieres estudiar.
Sobre lo que tú dices de "sacar medicamentos" y cosas de estas, lo ideal sería que te licenciaras en Biotecnología sanitaria, pero solo se da en Barcelona. Una opción es hacer Ingeniero Agrónomo e irte a la rama de Biotecnología, aunque te tragarías casi todo de plantas y demás (esto es lo que yo estoy haciendo), o directamente la licenciatura de Biotecnología en el Politécnico. Ambas se dan en la ETSIA de la UPV. O incluso podrías optar por irte directamente a Medicina, lo cual para lo que tú quieres quizá sea la mejor opción ya que es la más especializada en el tema, aparte de Biosanitario, aunque de estas carreras controlo bastante poco.
Como dato curioso uno de los principales investigadores sobre el Alzheimer es profesor en la Escuela de Agrónomos en la UPV, y es agrónomo biotecnológico, osea que con dos cojones te valdría, pero suele ir más hacia otra rama la agronomía.