A mí me gustaría lo siguiente:
-Poder aprender MO sin necesidad ( a elección ) de tener que ocupar una casilla en los ataques a la hora de combatir, es decir, que sea solo un movimiento "externo", o si quiere el usuario, que sí ocupe esa casilla.
-Que el juego sea en tercera persona
-Que los pokémon que se usen para MOs salgan a la hora de usarlas (surf, vuelo, etc )
-Darle más utilidad al juego una vez se acaba la historia, por ejemplo, poder entrenar pokémon para "carreras de surf" online, o que te den títulos en competiciones online y premios según tu puntación a final de cada torneo y poder desbloquear así lugares nuevos, etc...
-Que los pokémon legendarios sean re-capturables en cierta época del año.
-Que se respeten el tamaño de los pokémon, es decir: en XY y ROZA, en combates dobles, un gengar es del mismo tamaño que un venusaur O_O.
-Más medallas, una segunda vuelta más difícil del Alto Mando, o mejor aún, poder enfrentarte a todos los Altos Mandos hasta el momento y que al final de vencerlos te den una recompensa, con un nivel de dificultad alto y estrategias buenas en dichos altos mandos.
-Inventar nuevas habilidades para compensar a los pokémon menos competitivos (Steelix, Raichu, etc..)
-Que exista una región extra en el siguiente juego (por mí sería Kanto, pudiendo ver como ha cambiado todo y que el famoso camión tuviera una utilidad).
-Poder usar algún medio de transporte (moto, globo, etc )
-¡Poder montarte en tus pokémon!
-Para hacer más competitivos a pokémon "malos" podrían aumentar el número de EVS a subir, siguiendo un patrón que se trataría de lo siguiente: los pokémon que no lleguen a superar un cierto número base en sus características, podrán aumentar un cierto número de EVS extra alguna de sus características.
Estas son las cosas que yo incorporaría en los nuevos juegos. Y vosotros?