Las físicas de Unity son no deterministas, mismas acciones en distintas máquinas no garantizan el mismo resultado, así que no se deben usar para miltiplayers basados en físicas.
Sin embargo estoy viendo que los de Besiege al final consiguieron sacar el multiplayer (me lo tengo que descargar de nuevo visto lo visto) así que de algún modo solucionaron el problema y lo que dije no tiene validez. A no ser que realmente no solucionaran nada y simplemente coordinen todos los objetos de la escena usando una máquina como referencia. El problema de eso es que hay mucho tráfico de red.