Me autorespondo en #39414 ; al parecer es un poco lioso el jugar con el Pro Controller de Switch en pc porque pese a que Steam le dio soporte blablabla, a la hora de la verdad tienes que estar configurando muchos juegos uno a uno, amén de que los juegos fuera de Steam es una paranoya jugarlos.
He dado con una solución cojonuda en Reddit.
Se trata de BetterJoyForCemu, y es basicamente un pequeño programita que ha creado un user llamado Davidobot. Tras un proceso de instalación extremadamente simple, cuando conectemos ya sea por usb (la forma en la que lo he probado yo) o por BT nuestro pc reconocerá el mando pro como uno de Xbox360 y lo emulará a la perfección, quitándonos todas esas pequeñas molestias que a día de hoy siguen existiendo para jugar con el Pro Controller.
Y además no sólo eso, hace lo propio también con los Joy cons, de forma que pueden usarse tanto como pads independientes o usar un par para usarlos como mando completo.
Debo decir que tras un rato googleando y teniéndolo en el pc ya, es la putísima hostia el programita xD
Zelda: Breath of the Wild 
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