#407 En Tokyo depende de lo que quieras hacer si mas oeste o este, me quedaría por Toshima o el sur de Taito. Shibuya, Shinjuku, Minato, Chuo, Meguro etc... No los recomiendo la verdad. Toshima y Taito top para turistas con diferencia. Calidad/precio hotel (APA), transportes, tranquilos, cosas para ver...
Lo de la Yamanote da bastante igual la verdad.
Desde Toshima o Taito tienes todo a unos 45 minutos maximo ir de oeste a este o reversa, por ejemplo Tosihma a Ginza o desde Akihabara a Shibuya. Y si estas en Toshima te queda todo el oeste Shinjuku y Shibuya, y desde Taito tienes Akihabara, Asasuka, todo Chiyoda. A 20 minutos.
Si en lugar de toshima te vas al centro de shinjuku, pagaras el doble por el apa, estará lleno de gente y turistas, mucho ruido, ganaras 15 minutos de tiempo de tren directo...
Y las zonas de oficinas a lo Roppongi yo no las recomiendo ni visitar a turistas. Mucho menos quedarte ahí y pillarte 15 minutos de linea de tokyo y luego ir donde quieras otra media hora... Lo mismo Meguro y similares. Si quieres ir ahí que sea un día de paseo, no quedarte.
Mis 5cts, solo mi opinión.
En Kyoto te puedes quedar en el centro, en cualquier lugar no* importa mucho. *A no ser que vayas mucho a Osaka o pueblos de ahí, entonces mira que te queden bien los Shinkansen porque si que el metro tiene menos frecuencia.